Для начала надо скачать файлы, имеющиеся в репозитории.
Надо зайти на страницу проекта, и там сразу заметна ссылка на репозиторий:
Копируем её.
Затем заходим через ssh на хостинг, в директории, соответсвующей вашему виртуальному хосту выполняем команду
git clone ваша_ссылка
Скопируется вся структура файлов из нашего репозитория. Скорее всего это будет как минимум дополнительная подпапка...